O tratamento da infecção meningocócica depende da forma clínica da doença. Em caso de nasofaringite, o tratamento é sintomático. Se o diagnóstico for confirmado bacteriologicamente, benzilpenicilina, ampicilina, cefalosporinas de primeira e segunda gerações, cloranfenicol e pefloxacino são utilizados em doses terapêuticas médias por 3 dias. Cotrimoxazol e aminoglicosídeos, aos quais a maioria das cepas de meningococo atualmente existentes são resistentes, não devem ser utilizados.